三槽梯度PCR儀除具標準PCR儀功能外，其梯度模塊還能同時進行多達12個不同退火溫度的PCR反應，在梯度模塊上，可實現對梯度溫度和梯度寬度等參數的調整，自由編程12道溫度，梯度實現不同樣品的退火溫度并同時進行熱循環。僅一次實驗就能確定特定體系相應的退火溫度。從而可在短時間內對PCR實驗進行優化，大大提高PCR 科研效率。是針對每臺PCR儀如何設置合適的退火溫度進行摸索。它是以合成引物的退火溫度為參考值，在進行同一個PCR反應時，同時設置多個退火溫度進行PCR實驗。這些退火溫度呈現梯度遞增或遞減，通過梯度PCR確定適合儀器的退火溫度。

　　三槽梯度PCR儀標準操作程序：

　　1.使用前打開電源，預熱20分鐘。

　　2.待機器自檢完成后，進入主界面。

　　3.點擊“Browse/New Methods”按鍵，進入試驗程序設置。

　　4.可在下面列表單中選擇近期用戶保存的試驗程序，然后點擊“View/Edit”，進行編輯使用；也可直接點擊“New”按鍵，進行新的試驗程序設置。

　　5.點擊“Add”“Delete”按鍵，可增刪試驗步驟。

　　6.點擊“Save”按鍵可保存當前試驗程序，方便下次試驗使用。

　　7.待所有試驗程序設置完畢后，打開熱蓋，加入樣品，應盡量使樣品集中在樣品槽中央部位，點擊“Run”按鍵，進入試驗狀態。

　　8.試驗完成后，取出樣品，關閉電源。

　　三槽梯度PCR儀現已被廣泛應用于分子生物學、醫學、食品工業、司法科學、生物技術、環境科學、微生物學、臨床診斷、流行病學、遺傳學、基因芯片、基因檢測、基因克隆、基因表達等領域以聚合酶鏈式反應（Picymerase Chain Reaction , PCR）為特征的、以檢測DNA/RNA為目的的各種病原體檢測及基因分析。